Storno faktúry robíš vtedy, ak chceš zrušiť faktúru, ktorá ešte "nevyšla von", teda nedostala sa k zákazníkovi, nedostala sa do účtovníctva, po storne akoby neexistovala. Storno je interná záležitosť. Dobropis robíš v prípade, že faktúra išla zákazníkovi, dobropis je opravná faktúra, ktorú máš tiež poslať zákazníkovi, a obidva doklady, faktúra aj dobropis, sa účtujú.
V tvojom prípade však, ako tu bolo dobre poradené, je možné vystavovať zálohové faktúry, a po zaplatení až vystavovať riadne faktúry. Zálohové faktúry sú nezáväzné, neúčtujú sa, a nie je problém, keď zostanú neuhradené.